В основу мира Покемонологии легла фантазия разработчиков, а также элементы оригинального мультсериала. Поэтому не стоит удивляться, если сюжетные линии, неожиданные повороты, персонажи и сами покемоны будут несколько отличаться от привычной серии игр.